Bisnis.com, JAKARTA— Pekerjaan penting memeriksa bagaimana virus corona menyerang sel kita juga dapat membuka kunci perawatan obat yang potensial.
Dalam pertempuran melawan COVID-19, Anda membutuhkan senjata sebanyak mungkin di gudang senjata Anda. Tidak ada salahnya jika Anda memiliki superkomputer terkuat dan tercepat di Australia dan belahan Bumi Selatan.
Itulah yang dimiliki peneliti Australian National University (ANU) Asssociate Professor Megan O'Mara di ujung jarinya. Dia menggunakan Gadi, bertempat di National Computational Infrastructure (NCI Australia) di kampus ANU untuk membantu memahami bagaimana virus corona menyerang sel manusia.
Begitu kuatnya Gadi, ia telah dinobatkan sebagai anggota COVID-19 High Performance Computing Consortium pimpinan AS. Ini juga memungkinkan Associate Professor O'Mara dan anggota timnya, Dr Katie Wilson dan Dr Stephen Fairweather, untuk menjalankan simulasi pada 800.000 atom dalam reseptor kunci di tubuh kita yang dieksploitasi oleh virus corona untuk menyerang sel kita.
Menggunakan 48 prosesor yang berjalan selama 19 hari untuk menyelesaikan 64 simulasi pada tingkat molekuler, penelitiannya akan menghabiskan sekitar 13 juta jam waktu komputasi dalam beberapa bulan mendatang.
Sebaliknya, pekerjaan yang sama akan memakan waktu sekitar 1.500 tahun bagi manusia di satu komputer dan melakukan perhitungan konstan. Jika diibaratkan bermain Fortnite, apa yang akan dilakukan Gadi dalam waktu kurang dari tiga minggu sama dengan 26,5 tahun penggunaan non-stop pada mesin game kelas atas.
Profesor O'Mara akan menggunakan temuan dari simulasi komputer untuk memahami langkah pertama penularan oleh virus. Dia mengatakan pekerjaan penting ini tidak hanya akan membantu kita memahami bagaimana virus menyerang sel kita, tetapi dapat mengarah pada rancangan obat yang ditargetkan untuk menghentikannya.
"Hanya dengan pemodelan resolusi tinggi yang secara akurat mereplikasi perilaku sebenarnya dari reseptor ini, kami dapat mengetahui di mana kerentanan dalam proses pengikatan virus," kata Associate Professor O'Mara, seperti dikutip dari laman Australian National University, Kamis (13/8/2020).
Dia menilai menargetkan interaksi antara reseptor manusia dan protein pengikat virus corona mungkin menjadi arah yang berguna untuk desain obat. Proyek ini akan menghasilkan informasi penting pertama di dunia tentang wilayah reseptor yang dapat menjadi target vaksin atau obat potensial.
"Kami akan menggunakan komputer untuk menyaring obat yang mengikat kompleks reseptor dan dengan demikian dapat mencegah perubahan yang diperlukan untuk pengikatan virus. Tujuan kami adalah untuk mengidentifikasi obat yang dapat menghentikan virus menginfeksi sel manusia,” ujarnya.
Menurutnya, alokasi dari NCI ini mutlak penting untuk penelitian mereka. Kompleks reseptor sangat besar dan rumit sehingga superkomputer Gadi baru NCI adalah satu-satunya superkomputer di belahan Bumi Selatan yang cukup kuat untuk melakukan simulasi ini.
Superkomputer NCI Gadi diberi nama dalam bahasa Ngunnawal lokal yang berarti "mencari". Ditugaskan pada akhir 2019, Gadi berada di peringkat # 24 di TOP 500 Juni 2020 - peringkat superkomputer tercepat di seluruh dunia. Gadi didanai oleh investasi AUD$70 juta dari Pemerintah Australia.
Semalam, Kantor Sains dan Teknologi Gedung Putih menunjuk Gadi dan Nimbus Pawsey Supercomputer Centre CSIRO sebagai anggota Konsorsium Komputasi Kinerja Tinggi COVID-19 yang dipimpin AS.
Sebagai "Respon Cepat HPC COVID-19 Australia (NCI Australia dan Pawsey Supercomputing Center)", kedua superkomputer tersebut akan tersedia bagi para peneliti dari seluruh dunia yang menangani COVID-19 dari berbagai sudut.
Konsorsium AS adalah upaya swasta-publik unik yang dipelopori oleh Kantor Kebijakan Sains dan Teknologi Gedung Putih, Departemen Energi AS, dan IBM untuk menyatukan pemerintah federal, industri, dan pemimpin akademis yang secara sukarela menyumbangkan waktu dan sumber daya komputasi gratis di mesin kelas dunia.
